目的研究玉屏风加苍耳子散加减方（YCD）对反复呼吸道感染（RRTI）患儿肠道菌群的影响。方法 选取2018-2019年我院3～6岁11例RRTI患儿，随机分为YCD治疗组6例，泛福舒（OM-85）治疗对照组5例，分别收取治疗前、治疗2周、治疗4周和治疗3月的粪便，同时选取同年龄段的44例健康儿童作为正常对照组并收取粪便。所有标本进行16S rDNA高通量测序，分析YCD和OM-85治疗RRTI患儿病情变化与肠道菌群变化的相关性并预测菌群功能。结果 YCD治疗RRTI患儿4周至3月的疗效好于OM-85（P＜0.05）。RRTI患儿与正常儿童的肠道菌群组成结构有显著差异（P＜0.001）。RRTI患儿肠道菌群在治疗前后菌群丰富度和多样性均高于正常儿童（P＞ 0.05），但治疗后的组间差异均较治疗前减小（P＞0.05）。YCD治疗前后的拟杆菌门、放线菌门和拟杆菌属、嗜血杆菌属、梭菌ⅩⅣa属、副拟杆菌属、芽殖菌属的相对丰度变化与YCD疗效规律协同并与功能代谢通路相关（r＞0.5,P＜0.001）。其中，拟杆菌属、副拟杆菌属和芽殖菌属分别为治疗4周和3月的核心菌属。结论 YCD可以调节RRTI患儿肠道菌群失衡来改善患儿病情，尤其在疾病后期为RRTI患儿的防治提供新思路。