目的 通过研究新型冠状病毒感染（新冠病毒感染）疫情背景下慢性非传染性疾病（慢性疾病）患者住院期间心理健康状况及影响因素，为医疗机构在疫情环境下改善慢性疾病患者负性心理状况、促进其全面康复提供依据和参考。方法 采取方便抽样法选取昆明医科大学第一附属医院2021年8—9月收治的276例慢性疾病住院患者为研究对象，结合社会支持评定量表、焦虑自评量表、抑郁自评量表自行设计问卷进行调查，收集数据进行统计分析。结果 276例慢性疾病住院患者负性心理表现明显，抑郁阳性检出率为30.43%（84/276）,焦虑阳性检出率为18.12%（50/276）,13.77%（38/276）的焦虑阳性患者同时具有抑郁症状。慢性疾病住院患者社会支持水平与焦虑、抑郁得分呈负相关（r=-0.141、-0.220,P＜0.05）,其中25.72%（71/276）患者社会支持水平较差。患者焦虑的最主要影响因素为平均住院时间（P＜0.05）,患者抑郁的最主要影响因素有住院手续与无疫情时相比情况、平均住院时间、社会支持水平、个人饮酒史等（P＜0.05）。结论 新冠病毒感染疫情背景下慢性疾病住院患者焦虑、抑郁阳性检出率均高于非疫情时期，焦虑、抑郁症状严重程度以轻、中度为主，提示医疗机构在疫情防控期间应加强对此类患者心理健康的关注，通过提前性、综合性手段进行干预，加强健康宣教与心理疏导，促进患者全面康复。