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舌黏膜癌变基因组甲基化分析

Global analysis of DNA methylation changes during experimented lingual carcinogenesis

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资源类型:
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收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C ◇ 卓越:梯队期刊

机构: [1]云南大学附属医院口腔颌面外科 [2]昆明医科大学第一附属医院病理科 [3]昆明医科大学第一附属医院整形外科颌面组
出处:

关键词: 舌癌 发病机制 甲基化 动物模型 甲基化DNA 免疫沉淀测序 差异表达基因

摘要:
目的 研究舌黏膜癌变过程中基因组甲基化特征,探讨舌癌中DNA甲基化的规律。方法 用50 mg/L的4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水诱导C57BL/6J小鼠舌黏膜癌变,分别取第0、12、28周的舌黏膜(分别代表正常、癌前病变和癌变)进行基因芯片检测和甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq),在人舌黏膜组织和人舌癌细胞系中,用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和飞行质谱检测验证转化生长因子贝塔信号蛋白1 (SMAD1)的表达和启动子的甲基化。结果 28周较12周和0周舌黏膜的胞嘧啶鸟嘌呤岛(CGI)甲基化水平均升高,12周时启动子甲基化水平高于0周。在0、12和28周期间,208个差异表达基因与启动子中的差异甲基化呈负相关。与正常黏膜相比,细胞系中SMAD1的mRNA上调,同时启动子甲基化水平降低。结论 舌黏膜癌变中伴随DNA甲基化修饰异常,舌癌中SMAD1高表达伴启动子低甲基化。

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第一作者:
第一作者机构: [1]云南大学附属医院口腔颌面外科
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资源点击量:53617 今日访问量:17 总访问量:1665 更新日期:2024-11-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

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