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胆囊结石的高通量测序及生物信息学分析

Integrating microRNA and mRNA expression profiles in gallbladder stone through high-throughput sequencing technologies

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-E ◇ 中华系列

机构: [1]昆明医科大学第一附属医院肝胆外科 650032
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摘要:
了解胆囊结石的发病机制及其重要意义. 一、材料与方法 1.一般资料:收集昆明医科大学第一附属医院10例胆结石患者和10例非结石患者的胆囊黏膜,用Illumina HiSeq 2500测序仪行高通量测序. 2.数据分析:对比分析微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA)两者之间表达差异的基因并构建胆囊结石差异miRNA和mRNA表达谱及调控网络. 二、结果 将差异表达的miRNA所预测的靶基因出现在两组样本中共表达的mRNA利用起来,进行差异miRNA和基因调控网络图的构建.在所有结果中找到1条基因:miR-210和三磷酸腺苷结合盒转运同源基因(ATP11a).

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第一作者:
第一作者机构: [1]昆明医科大学第一附属医院肝胆外科 650032
通讯作者:
通讯机构: [1]昆明医科大学第一附属医院肝胆外科 650032
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