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基于通路分析的重型痤疮全基因组关联研究

Pathway-based analysis of genome-wide association study data on severe acne

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文献详情

资源类型：
WOS体系：

收录情况： ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C ◇ 中华系列

作者：
杨健康[1] ; 冯家祺[1] ; 张平[3] ; 曹光琼[4] ; 何黎[1] ; 吴文娟[1] ;
机构： [1]大理大学基础医学院,云南,671000 [2]昆明医科大学第一附属医院皮肤科 [3]云南曲靖市第一人民医院检验科 [4]昆明医科大学第一附属医院体检中心
出处：
DOI： 10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2018.09.005
ISSN：

关键词： 寻常痤疮 全基因组关联研究 通路分析

摘要：
目的 探讨与重型痤疮相关的基因通路.方法 使用全基因组关联研究(GWAS)的芯片数据,包括1 056例重型痤疮患者和1 056例健康对照标本,每个标本检测900015个SNP位点.对重型痤疮进行基因通路(KEGG数据库定义)分析.采用超几何分布检验计算每条通路与重型痤疮的关系,使用错误发现率(FDR)对得到的结果进行多重检验校正,校正后P＜0.05视为通路与重型痤疮相关.结果 统计分析发现12条基因与重度痤疮相关(P＜ 0.001),包括TMPRSS11E、DDB2、RIC1、CLLU1OS、IL3、PLA2G4B、SLC16A14、SOX17、FAHD2A、ENTPD7、MRPL50、TXLNB.通路分析发现,5条通路与重型痤疮相关(校正后P＜ 0.05),包括催乳素信号通路、丙型肝炎、肾细胞癌、高亲和力IgE受体信号通路、酪氨酸代谢.结论 本研究发现5条通路与重型痤疮相关,分别涉及人体的内分泌、免疫、代谢等过程.

基金：
国家自然科学基金(81760565、81460469、U1402223、81360234)%云南省卫生科技计划项目(2016NS008)%大理大学博士科研启动基金(KYBS201603)National Natural Science Foundation of China(81760565,81460469,U1402223,81360234)%Health Science and Technology Planning Project of Yunnan Province(2016NS008)%Doctoral Scientific Research Foundation of Dali University(KYBS201603)

基金编号： 81760565、81460469、U1402223、81360234

语种：
中文
第一作者：
第一作者机构： [1]大理大学基础医学院,云南,671000
推荐引用方式(GB/T 7714)：
杨健康,冯家祺,张平,等.基于通路分析的重型痤疮全基因组关联研究[J].中华皮肤科杂志.2018,51(09):658-661.

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