资源类型:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
文章类型:
机构:
[1]云南省第二人民医院昆明医科大学第四附属医院呼吸与危重症医学科
[2]昆明医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科
昆明医科大学附属第一医院
呼吸与危重症一科
呼吸内科
内科科室
出处:
ISSN:
关键词:
哮喘
miRNA-mRNA网络
治疗靶点
小分子药物
摘要:
目的构建miRNA-mRNA网络,预测哮喘的治疗靶点和潜在的治疗药物。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载2个数据集,用edgeR进行基因表达差异分析。差异miRNAs的靶点由miRTarBase、miRDB和TargetScan预测,通过cytoscape构建miRNA-mRNA网络。基于Metascape进行功能富集,cMAP用于预测小分子药物。结果筛选出118个差异mRNAs和16个差异miRNAs。在miRNA-mRNA网络中,miR-101-3p、miR-96-5p和miR-429可能成为哮喘的治疗靶点。功能富集发现差异mRNAs主要与免疫应答、炎症反应、MAPK级联调节和TGF-beta信号通路等有关。此外,我们发现了5种哮喘的潜在治疗药物。结论成功构建miRNA-mRNA网络,miR-101-3p、miR-96-5p和miR-429均可能为治疗靶点,并预测了5种哮喘的潜在治疗药物。
基金:
国家自然科学基金资助项目
(81760015;81560694); 云南省科技
厅-昆明医科大学联合专项面上项
目(2018FE001( - 2 0 6 ) ) ; 云南省高
层次人才培养支持计划“ 名医”专
项;云南省卫生高层次人才培养计划
( H - 2 0 1 8 0 9 5 ) ;云南省中青年学术
和技术带头人后备人才
(2017H B 053); 昆明医科大学研究生
创新基金(2020S232)
基金编号:
81760015;81560694
第一作者:
第一作者机构:
[1]云南省第二人民医院昆明医科大学第四附属医院呼吸与危重症医学科
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
邢西迁,杨姣,白敏,等.哮喘miRNA-mRNA调节网络的构建与小分子药物的预测[J].中国临床药理学杂志.2021,37(4):454-457.