背景：目前，昼夜节律性自噬已逐渐成为生命科学和人类健康的研究热点，其在维持人类健康方面起着重要的作用，且诸多研究已证实昼夜节律紊乱导致的异常自噬会诱发各种疾病，如神经退行性变、癌症、衰老过程、自身免疫等。随着研究的深入，自噬与昼夜节律调节之间相关联的证据越来越多，但其相互调控机制尚未阐明。目的：探讨昼夜节律与自噬的关系，综述分子生物钟、自噬的昼夜节律、及昼夜节律与自噬相互调控机制的最新研究进展，并对其具体分子机制进行详细的概述。方法：以“circadian rhythm,autophagy,molecular circadian clock,regulation,gene”为英文主题词，以“昼夜节律，自噬，分子生物钟，调控机制，基因”为中文主题词，分别在PubMed数据库、Web of Science、中国知网以及万方数据库检索最新的相关中英文文献，根据纳入及排除标准最终纳入107篇文献进行归纳总结。结果与结论：（1）昼夜节律是由分子生物钟产生的24 h生理和行为节律，分子生物钟与其产生密切相关，主要是通过BMAL1:CLOCK异源二聚体与靶分子启动子中的E-box结合，进一步激活Cry、Per、Rev-erb和Ror基因的转录，从而介导昼夜节律的产生；（2）一些参与自噬的基因、转录因子和通路在昼夜变化中具有节律性，其受多个昼夜节律生物钟核心成分（如Per2、BMAL1和REV-ERB）的调控，是功能上连接昼夜节律和自噬的桥梁；（3）此外，一些分子与药物也能影响自噬和昼夜节律，在节律性自噬的调控中起着至关重要的作用。