目的：分析在恩替卡韦治疗的基础上，予以乙型肝炎合并脂肪肝患者联合水飞蓟宾治疗的临床效果。方法：对我院收治的乙型肝炎合并脂肪肝患者予以选取，实验时间为2021年1月至2022年8月，共计200例样本，用密封信封抽选完成分组操作，对照组（100例）施以恩替卡韦治疗，在对照组的基础之上，研究组（100例）予以本组所纳入对象恩替卡韦联合水飞蓟宾治疗，比对组间治疗效果、治疗前后肝功能指标、血清细胞因子水平、血脂水平、不良反应发生率。结果：研究组的治疗有效率（96.00%）相较于对照组（88.00%）要高（P<0.05）。治疗前组间肝功能指标相近（P>0.05），治疗后，研究组的ALT（49.36±18.96）TU/L、HBV-DVA（2.89±0.48）IU/ml、AST水平（60.23±10.47）TU/L均比对照组要低（P<0.05）。治疗前组间血清细胞因子检测水平相近（P>0.05），治疗后，研究组的TGF-β（157.98±14.31）μg/L、TNF-α（68.17±13.02）μg/L、IL-6水平（204.72±25.85）μg/L均比对照组要低（P<0.05）。组间治疗前血脂检测水平相近（P>0.05），治疗后，研究组TG（1.82±0.65）mmol/L、TC（3.79±0.58）mmol/L、LDL-C水平（2.26±0.47）mmol/L均比对照组低，HDL-C水平（1.63±0.75）mmol/L相比对照组高（P<0.05）。研究组的不良反应发生率（3.00%）相较于对照组（10.00%）低（P<0.05）。结论：在恩替卡韦治疗的同时，为患有乙型肝炎合并发生脂肪肝的患者实施联合水飞蓟宾治疗有确切效果，可改善患者肝功能、血脂水平，有推广意义。