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◇ 统计源期刊
文章类型:
机构:
[1]云南省中医医院检验科
[2]昆明医科大学第一附属医院检验科云南省实验诊断研究所云南省检验医学重点实验室
昆明医科大学附属第一医院
省级研究所
云南省实验诊断研究所
医学检验科
医技科室
出处:
ISSN:
关键词:
肺炎克雷伯菌
全基因组测序
耐药性
毒力
基因
质粒
抗生素
染色体
摘要:
目的 分析碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae, CRKP)T361株的耐药及毒力基因携带情况。方法 肺炎克雷伯菌T361株分离自昆明医科大学第一附属医院干部医疗科患者的痰液标本。采用Vitek-2 compact系统对菌株进行鉴定和药物敏感性试验。使用PCR检测菌株的耐药基因。并用Illumina Hiseq 4000高通量测序平台对其进行全基因组测序,分析菌株携带的耐药及毒力基因。结果 肺炎克雷伯菌T361株对头孢菌素类、碳青霉烯类、氨基糖苷类、氟诺喹酮类、磺胺类、β内酰胺/β内酰胺酶抑制剂复合物、呋喃妥英及替加环素等抗生素均耐药。PCR检出blaKPC-2、blaTEM、blaSHV及blaCTX等耐药基因。全基因组测序得到1条完整的基因组序列(GenBank登录号:CP053016)及4条质粒序列(GenBank登录号:CP053017、CP053018、CP053019、CP053020)。在染色体基因组中发现,有44种耐药相关基因,包括blaSHV-11、ompK36、ompC、ompK37、lamB等;有50多种毒力基因,包括fimD、mrkC、mrkD、ybtE、ybtT等。在质粒1(pKPN361-1)中发现了4种耐药基因,包括blaCTX-M-65、blaTEM-1、rmtB和blaKPC-2;质粒2(pKPN361-2)中发现了6种耐药基因,包括tet(A)、sul1、mphA、aph(3′)-Ia、blaLAP-2和aac(3)-IId;质粒3(pKPN361-3)和质粒4(pKPN361-4)中未检测到耐药基因,并且4个质粒中均未发现毒力基因。结论 碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌T361株中携带了大量耐药及毒力基因且产酶耐药基因位于质粒上,造成其易传播,临床上须引起高度重视。
基金:
云南省基础研究计划中医联合专项青年项目[2019FF-002(-081)];云南省基础研究计划中医联合专项面上项目(202101AZ070001-205);云南省基础研究计划中医联合专项青年项目(202001AZ070001-095);
基金编号:
-081
第一作者:
第一作者机构:
[1]云南省中医医院检验科
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
杜娜,杜艳,刘曦,等.全基因组测序对碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌t361耐药及毒力基因的分析[J].微生物学免疫学进展.2023,51(2):53-59.