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胃癌相关环状RNA筛选及环状RNA_0009172在肿瘤糖酵解过程中作用分析

Screening of gastric cancer-associated circular RNAs and role of circular RNA _0009172 in the glycolysis process

文献详情

资源类型:
中文论文体系:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 中华系列

机构: [1]昆明医科大学第一附属医院肿瘤外科,昆明 650032 [2]昆明学院医学院,昆明 650214 [3]昆明医科大学第一附属医院临床药学中心,昆明 650032
出处:
ISSN:

关键词: 胃癌 环状RNA A激素锚定蛋白12 糖酵解

摘要:
目的:通过生物信息学分析筛选胃癌相关的环状RNA(circRNA),并对确定的环状RNA_0009172(hsa_circ_0009172)在胃癌中的表达及功能进行分析。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中筛选胃癌与癌旁正常组织的差异表达circRNA,并确定hsa_circ_0009172作为研究对象;结合肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库的胃癌临床数据集进行分析,采用R软件包进行统计计算,将数据值校正后以 P<0.05且表达变化≥1.5倍为阈值,确定差异表达RNA。通过分析确定hsa_circ_0009172在胃癌中的差异表达、在糖酵解过程中的作用及其通过内源竞争RNA(ceRNA)方式发挥作用的机制。进一步收集2023年12月至2024年6月于昆明医科大学第一附属医院胃癌患者手术标本25例,选取新鲜胃癌及癌旁正常组织,其中男15例、女10例;年龄(38~72)岁,平均年龄(57.04±7.84)岁。应用荧光实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)对hsa_circ_0009172的表达情况进行验证,同时对筛选出的ceRNA中的hsa-miR-942和A激素锚定蛋白12(AKAP12)基因进行检测,用相关分析计算3个分子间关系。符合正态分布的采用 t检验;不符合正态分布的采用Man-Whitney U检验。 结果:与癌旁正常组织比较,胃癌组织中表达降低的circRNA为2 836个,增高的为89个,筛选出在胃癌组织中表达降低的hsa_circ_0009172(0.77±1.53比2.67±0.43, t=-2.05, P<0.05)为后续研究对象。通过筛选hsa_circ_0009172的靶microRNA,发现其中hsa-miR-942在胃癌中高于癌旁正常组织(3.41±1.06比2.42±1.30, t=5.56, P<0.01);通过分析hsa-miR-942的靶mRNA,确定hsa_circ_0009172可能与hsa-miR-942、AKAP12形成ceRNA参与了胃癌的糖酵解过程。qRT-PCR结果与生物信息学结果符合。胃癌组织中hsa_circ_0009172、AKAP12表达水平低于癌旁组织(0.80±0.28比1.23±0.83、1.22±0.40比2.60±1.18, t=-2.52、-4.55, P<0.01);hsa-miR-942在肿瘤中表达水平(3.23±0.40)高于癌旁组织(0.92±0.43, t=19.70, P<0.01)。 结论:hsa_circ_0009172可能通过调控hsa-miR-942-AKAP12轴形成ceRNA参与了胃癌糖酵解过程。

基金:

基金编号: 202101BA070001-033、202401 AU070041

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]昆明医科大学第一附属医院肿瘤外科,昆明 650032
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):

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