目的：探讨胆囊结石和非结石患者胆囊黏膜中miRNA表达谱的差异。方法选取30例胆结石患者（结石组）和30例胆囊息肉患者（非结石组）的胆囊黏膜组织，采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术进行深度测序，比较2组的microRNA表达差异。对差异表达的miRNAs进行筛选与靶基因预测，并进行GO和KEGG功能显著性富集分析。荧光定量RT-PCR（qRT-PCR）对差异表达miRNAs进行验证。结果结石组和非结石组分别获得2215832和1424770条序列，平均长度22 nt。2组间显著差异表达的miRNA共计17个，其中9个表达上调，8个表达下调。GO分析结果示靶基因富集于离子的结合和转运、载脂蛋白结合、钙离子通道激活、蛋白激酶活性等分子功能以及大分子的合成和代谢、类固醇激素生物合成和代谢等生物进程。KEGG通路富集分析示靶基因多集中于癌症相关通路，包括WNT、Hippo等信号通路。qRT-PCR结果示差异性miRNA的表达趋势与测序结果相一致。结论差异表达的miRNA可能在胆囊结石的形成中具有重要作用。