目的分析上报国家卫健委临床检验中心新生儿遗传代谢病筛查（新筛）中心的先天性甲状腺功能减低症（CH）16项质量指标的反馈结果,总结新筛流程中各项工作环节的质量问题。方法昆明医科大学第一附属医院新筛中心按照各项质量指标的数据填报要求,通过Clinet-EQA网络系统中的新筛质量指标分析平台,于2016年至2019年定期向国家卫健委临床检验中心上报CH质量指标的相应数据,并对反馈结果进行总结分析。结果在2016年至2019年中,每年填报上一年度新筛16项质量指标。不分病种的新筛健康教育知晓率、筛查率、检验前血片周转时间及时率（除外2015年,为89.51%）、检验报告发出时间及时率和室内质控开展率5项指标均≥90%,而不合格血片百分率（除外2016年,为1.07%）、重要信息遗漏血片百分率、室内质控变异系数不合格率和失访率4项指标均≤1%。分病种的质量指标结果与全国平均水平横向比对存在差异:CH的初筛阳性率（除外2015年）、筛查阳性率、初筛阳性召回率（除外2018年）、阳性预测值（除外2018年）、筛查病种患病率、筛查假阴性率（除外2018年）均低于全国平均水平（χ2=0.064～308.536,均P(0.05）,召回阳性率均高于全国平均水平（χ2=45.299～159.793,均P(0.05）;4年的质量指标结果纵向比较,CH的初筛阳性率、筛查阳性率、召回阳性率呈逐年降低趋势（χ2值分别为58.483、121.359、79.264,均P(0.05）,阳性预测值呈逐年增高趋势（χ2=25.741,P(0.05）,假阳性率不断降低;CH的初筛阳性召回率也呈逐年增高趋势（χ2=84.536,P(0.05）,筛查病种患病率变化较小。结论参加新筛质量指标室间质量评价并对反馈结果进行总结分析,利于及时发现问题并加以解决,评估和提高整个新筛工作流程中各环节的工作质量,以保证提供标准化、同质化的新筛服务。