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2007和2008年10-12月腹泻患儿诺如病毒分子的检测

Clinical study and detection of norovirus in young children with diarrhea from October to December in 2007 and 2008

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文献详情

资源类型:
WOS体系:
机构: [1]昆明医科大学附属延安医院儿科云南,昆明,650051 [2]昆明医科大学第一附属医院儿科云南,昆明,650032
出处:

关键词: 诺如病毒 儿童 肠炎 PCR 测序

摘要:
目的:分析2007年和2008年10~12月昆明地区部分婴幼儿腹泻散发病例中诺如病毒(Norovirus,NoV)感染情况.方法:收集2007年10~12月及2008年10~12月在昆明医学院第一附属医院儿科住院的腹泻患儿的粪便标本96份,其中2007年有46份,2008年有50份.应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中诺如病毒核酸,并随机挑选2007年和2008年各一份RT-PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序,测序结果应用DNAassist、Clustal-w和MEGA 4.0软件进行序列分析.结果:96份标本共12份检出NoV阳性,阳性检出率为12.5%,其中2007年有7份NoV阳性,阳性检出率为15.2%,2008年有5份NoV阳性,阳性检出率为10.0%.用DNAassist、Clustal-w和MEGA 4.0软件进行序列分析.该两株病毒的组内核苷酸同源性为97.3%,与GenBank上GⅠ组:Norwalk68,SouthamptonVirus,BS5,WUG1,Chiba Virus的同源相似性在82.5-95.7%之间,而与GⅡ组Farmington Hills,B4S5,MD145 Maryand virus,Lordsdale Virus,Mc37,Saitama U1,Hawaii,Snow MountainVirus,SaitamaU4的全基因组序列进行比较,同源性在51.9-62.5%之间.结论:2007年和2008年10~12月昆明地区部分婴幼儿腹泻散发病例中均存在诺如病毒的感染,且所检测的两份标本为同一型,同属于GⅠ型.

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]昆明医科大学附属延安医院儿科云南,昆明,650051
推荐引用方式(GB/T 7714):

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