目的 分析昆明医科大学第一附属医院新生儿遗传代谢病筛查中心不同出生胎龄新生儿干血斑中氨基酸、游离肉碱和酰基肉碱水平，并分别建立其参考区间，降低假阳性率或假阴性率，提高阳性预测值。方法 选取2013年1月至2020年12月在昆明医科大学第一附属医院新生儿遗传代谢病筛查中心做串联质谱筛查检测的52 526例新生儿干血斑标本作为研究对象，根据出生时胎龄不同分为早产组（32周≤胎龄<37周，n=5 694）和正常孕周组（37周≤胎龄≤42周，n=46 832），采用串联质谱法对其氨基酸、游离肉碱和酰基肉碱浓度进行检测及比较，并分别建立其参考区间（P0.5～P99.5）。结果 11种氨基酸及C0、C2、C3、C4、C5、C6、C8、C10、C14、C14:2、C16:1、C18:2的99.5%上限值，早产组高于正常孕周组；C6DC、C12、C16的99.5%上限值，早产组低于正常孕周组。C0的0.5%下限值，早产组高于正常孕周组；瓜氨酸、甲硫氨酸、C16、C18、C18:1的0.5%下限值，早产组低于正常孕周组。其余酰基肉碱的0.5%下限值与99.5%上限值在两组间无明显变化或相差不大。用重新设定的参考区间对部分筛查质量指标做前后对比分析，发现假阳性率在早产组和正常孕周组分别由8.17%、4.86%下降到3.72%、1.48%，差异有统计学意义（χ2值分别为18.480、16.359,P<0.05）；阳性预测值分别由0.56%、1.44%上升到2.17%、3.41%，差异有统计学意义（χ2值分别为11.898、12.149,P<0.05）。结论 不同胎龄新生儿氨基酸、游离肉碱和酰基肉碱浓度存在差异，分别建立了不同胎龄新生儿氨基酸、游肉离碱和酰基肉碱筛查的参考区间，为新生儿氨基酸、脂肪酸和有机酸代谢障碍性疾病的筛查及诊断提供了参考依据。