目的:探讨脑源性神经营养因子（brain derived neurotrophic factor, BDNF）基因多态性（Val66Met，rs6265）与首次发病未治疗抑郁症患者的大脑灰质体积的相关性。方法:采用3.0 T磁共振成像对41例抑郁症患者（患者组）以及44名性别、年龄与患者组相匹配的健康对照者（对照组）进行头部磁共振成像扫描，同时检测受试者的BDNF基因rs6265多态性。采用基于体素的形态学方法（voxel-based morphometry, VBM）建立全因子分析模型，分析诊断（抑郁症与健康）和基因型（Val/Val与Met）对全脑灰质体积的影响。结果:患者组与对照组rs6265基因位点多态性的基因型和等位基因频率差异均无统计学意义（χ 2=0.004、0.048，均 P>0.05）。诊断主效应脑区为左侧楔前叶（ F=3.702， P<0.001）、右侧颞中回（ F=4.020， P<0.001）、小脑蚓部_4_5( F=3.836， P<0.001)。BDNF基因型主效应脑区为左侧梭状回( F=-4.152， P<0.001)。诊断与基因交互效应脑区为左侧前扣带回( F=-4.775， P<0.001)及右侧前扣带回( F=-3.795， P<0.001)。进一步两两比较显示，在Val/Val纯合子携带者中，患者组较对照组左侧前扣带回( F=-3.729， P<0.001)灰质体积减小；在Met等位基因携带者中，患者组较对照组右侧枕下回( F=4.744， P<0.001)、左侧额中回( F=4.317， P<0.001)、右侧缘上回( F=3.838， P<0.001)、左侧中扣带回( F=4.041， P<0.001)灰质体积增大。 结论:BDNF rs6265位点等位基因与抑郁症相关脑区结构异常有关，可能参与了抑郁症的发病机制。