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◇ 中华系列
文章类型:
机构:
[1]昆明医科大学第一附属医院精神科 650032
内科科室
精神科
昆明医科大学附属第一医院
[2]中国科学院昆明动物研究所 650223
出处:
ISSN:
关键词:
阿尔茨海默病
线粒体
DNA
突变
摘要:
目的:探索线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)变异与早发家族性阿尔茨海默病发病风险的相关性。方法:从2014年3月至2020年4月收集到的早发家族性阿尔茨海默病家系样本中筛选出4个具有母系遗传特征的阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)家系样本,开展mtDNA全序列测序,与修正版的剑桥参考序列比对分析。测序结果根据标准序列记录下每个样本的mtDNA变异位点及相关信息。采用最新版的mtDNA分类系统数据库进行线粒体单倍型类群分类。变异分析方法:根据系统发育树,找出枝端私有变异位点;MitoTool分析变异的保守性;再通过PhyloTree查询突变是否为其他单倍型类群的鉴定变异。通过文献和数据库查询,SIFT致病性预测软件(2015)预测分析。通过I-TASSER 预测蛋白结构,Pymol可视化蛋白结构同源模拟蛋白三级结构分析,分析结构变化。结果:其中一个家系的mtDNA存在稀有非同义变异m.8978T>C,该位点保守系数1.0,致病性分数较高,蛋白结构同源模拟MT-ATP6蛋白三级结构分析,显示该蛋白支链残端的结构改变。结论:mtDNA稀有非同义变异m.8978T>C可能具有潜在的致病性,可能通过线粒体的功能下降影响AD的发病。
基金:
国家自然科学基金(81560230);云南省高层次卫生计生技术人才培养经费资助
(D‑2018046,H‑2018090)
基金编号:
81560230
第一作者:
第一作者机构:
[1]昆明医科大学第一附属医院精神科 650032
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
姜红燕,沈宗霖,毕蕊,等.早发家族性阿尔茨海默病患者线粒体基因组变异分析[J].中华精神科杂志.2021,54(5):325-330.