目的探索使用ImageJ在MRI T1WI图像上分割量化大腿皮下脂肪（subcutaneous adipose tissue,SAT）、肌内脂肪（intramuscular fat,IntraMF）及肌间脂肪（intermuscular fat,InterMF）的可行性。材料与方法对28名志愿者（包括14名2型糖尿病患者）行大腿中部MRI扫描,在轴位T1图像上对肌肉脂肪浸润程度进行Goutallier分级;通过ImageJ分割测量大腿SAT、IntraMF及InterMF的面积;通过定量非对称回波的最小二乘估算法迭代水脂分离序列（iterative decomposition of water and fat with echo asymmetry and least squares estimation quantification sequence,IDEAL-IQ）测量的脂肪分数以计算大腿肌肉内的脂肪面积。分析ImageJ分割方法和Goutallier分级与IDEAL-IQ脂肪定量方法的相关性。检测ImageJ分割方法的观察者内和观察者间可靠性。结果 ImageJ分割方法和IDEAL-IQ脂肪定量之间有很强的相关性（r=0.998,P(0.001）;ImageJ分割大腿SAT面积的观察者间及观察者内ICC均为0.999,P(0.001;大腿InterMF面积观察者间ICC为0.941,P=0.003,观察者内ICC为0.992,P(0.001;大腿IntraMF面积观察者间ICC为1.000,P(0.001,观察者内ICC为0.997,P(0.001。结论 ImageJ在MR T1序列上分割量化大腿SAT、IntraMF及InterMF具有良好的可靠性,且与IDEAL-IQ脂肪定量方法有很强的相关性。ImageJ分割是半定量Goutallier分级的一种可行替代方法。